杜文秀之乱，其实是多种因素搅和在一起的结果。道光朝末年，云南永昌的汉人和回民因为争夺矿藏而大打出手，放火杀人，杜文秀成了孤儿，只好跑到北京避难。到了同治元年，这位原本是半汉化的穆斯林秀才，被北京齐化门的阿訇金爷给看上了。金爷瞧出清朝政府不行了，就借着“新老教联合”的旗号，怂恿杜文秀借着受冤的由头，跟陕甘的矿工们拉上关系，悄悄打下军事基础。滇西那边乱成一锅粥，清朝的官员罗天池乱杀人，贺长龄又犹豫不决，最后杜文秀就带着大家伙儿造反了。咸丰六年，他们攻下了大理，建了个“苏莱曼苏丹”的国号，用阿拉伯历法，还印波斯文的诏书。更狠的是，他还偷偷从西北调来了一批狠角色，像任五、郝明堂这些人，让他们杀人见血，铁了心跟他干。
大理国虽说“安抚回民对抗汉人”，但实际上杀戮不断。同治五年，文秀的军队包围昆明，在坚固的城下驻扎了三百多天，把周围的村庄都变成了废墟。到了同治八年，他们又向东进发，率领二十万大军直接攻打滇东，一路上放火烧城，把汉人当奴隶驱使。更过分的是，他们还偷偷和奥斯曼的使者联系，给土耳其送去石英砂，妄图引来外国军队瓜分土地。到了同治十一年，岑毓英联合马现等回民将领反过来攻打大理，文秀看到大局已定，就吃了孔雀胆、抱着官印投降，临死前还叮嘱亲信：“快点烧掉库里的银子，别给清朝政府留下。”这场战乱给云南带来了十七年的灾难，害得将近五百万百姓失去了生命。
后人提起这场动乱，不单是因为回汉之间的仇恨相杀，其实更是因为朝廷内部腐烂、边疆管理崩溃所带来的恶果。杜文秀原本只是个穷书生，但被金爷用“突厥复兴”的妄想给迷惑了，心里的邪火越烧越旺；清朝的官员们安抚无策，军费和粮饷都被白白浪费，最终让西南的支柱崩塌成了一堆碎渣。历史教训明摆着：政治懈怠、官员贪污，就容易闹出乱子；边疆的百姓心不齐，外面的敌人就会趁机而入。虽然滇西的腥风血雨已经停了，但那些分裂土地的人到现在还在效仿，真是让人叹息，警告了多少次都不听啊！
当太平天国的大火在东南烧得江南人心惶惶时，西北的陇原大地上已悄悄长出了毒草。太平天国西征的军队，没想到却意外点燃了陕甘回民起义的火药桶。英王陈玉成在襄樊吃了败仗后，云南杜文秀的使者偷偷来到军营，用“联手攻打陕西，五百万教徒一起支持太平天国”的承诺，激起了他的野心。洪秀全的残兵败将和白彦虎的密探，在渭水边结成了怪异的联盟：汉地的反叛将领和西域的圣战者各有各的小九九，他们把土地不够用的难题，变成了双方互相残杀的怒火。缺粮少饷的太平军想抢关中的粮仓，他们的头领还盼着借别人的手拆掉清朝在西北的防线，历史的巧合竟然把这两股乱流搅在了一起。
在宁夏的头头儿很懂“两虎相斗，必有一伤”的道理，于是把三万多人马从云南调到陕西，“河南陕西运粮的争执”就成了最好的引爆点。新来的兰州大将军杨岳斌一到任，就吃惊地发现，清军的粮草账本竟然还没难民吃人的记录厚。另一边，杜文秀派回陕甘的使者郝明堂，正在大荔县的油坊里秘密搞滴血结拜。太平天国的沃王张乐行的捻军和白彦虎的叛军，在关中平原上你来我往，打得火热：张乐行为抢粮道，骑着马到处烧杀抢掠；白彦虎则趁机拉拢流民，搞了个“伊斯兰国”。这两股势力在关陇大地上，画出了奇怪又复杂的共存地图。赖文光骂“回民贼子只想着坑队友”，其实就是说这联盟不牢靠——信上帝的和拜真主的，虽然手拉手了，但心里都各打小算盘，互相利用罢了。
说来也怪，就在陈玉成带兵攻打潼关的时候，陕甘地区的汉人和回民正打得不可开交。渭北塬上，新加入伊斯兰教的十万汉人成了陕甘回民刀下的牺牲品，而陇东那边，二十万难民转眼间就成了白骨累累之地，这块地方却意外地成了吸引太平军西进的“无人区”。等到湘军在安庆切断了太平天国的补给线，陕甘的土地上已经找不到一粒粮食来养活大军，不管是太平天国洪秀全的信徒，还是高呼真主安拉的回民战士。这场太平天国和回民起义的交织战乱，最终把陕甘的肥沃土地烧成了焦土，五百万人丢了性命，千年的丝绸之路文明也变得破败不堪。
